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资料类型: |
JPG图片格式
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关键词: |
DNA 杂交 分子模拟 拉链模型 |
资料大小: |
96K |
所属学科: |
分子表征 |
来源: |
2013年全国高分子学术论文报告会(2013.10.12~16,上海) |
简介: |
DNA杂交机理是生物学领域一个广受关注的基础性问题,其成核细节尚不为人所知。Ouldridge等最近开发了一个新的粗粒化DNA模型—oxDNA,合理的拟合了DNA的氢键相互作用和堆叠相互作用,能够同时表现DNA单链的柔性和双链的刚性。到目前为止,该模型已经成功的应用于一系列的DNA结构以及DNA纳米器件的模拟,如DNA镊子和DNA行走机器人。我们以该模型为基础,通过引入赝动力学(metadynamics)和过渡路径采样(transitionpathsampling)方法,研究了短链DNA的杂交机理和成核机理。研究结果表明,只有单一重复序列才采用“滑行式(slithering)”的杂交方式,不遵循特定的路径;而对于一般随机序列,其采用“拉链式(zippering)”的杂交方式,有较为严格的形成路径。 |
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作者: |
朱红,梁好均
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上传时间: |
2013-11-14 16:41:36 |
下载次数: |
1 |
消耗积分: |
2
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