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| 资料类型： |
JPG图片格式
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| 关键词： |
肿瘤 蛋白质复合物 分子模拟 结合自由能 MM-PBSA 方法 |
| 资料大小： |
116K |
| 所属学科： |
分子表征 |
| 来源： |
2013年全国高分子学术论文报告会（2013.10.12~16，上海） |
| 简介： |
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肿瘤细胞的存活与否取决于其凋亡过程的分子调控能力，而一系列的蛋白质复合物是该过程得以行使的载体。其中，A1属于促存活蛋白；而BMF、PUMA属于促凋亡蛋白，称之为BH3-only蛋白或BH3多肽。它们之间形成蛋白复合物，其结合的强弱直接影响着肿瘤细胞的凋亡过程。我们对A1蛋白和BH3多肽的复合物进行了分子模拟；基于MM-P(G)BSA方法，计算了几种复合物的结合自由能及每个残基的贡献，发现不同多肽的结合机制存在差别；根据这一差别，对多肽进行突变，获得了结合能力更强的蛋白－多肽复合物。研究发现，尽管BH3多肽中间的热点残基对结合能贡献最大，但不同多肽结合能力的差异更多地体现在多肽的两个末端片段上。或者说，多肽中间残基的疏水作用体现了BH3多肽与A1蛋白结合机制的共性，而末端残基更多地体现出不同BH3结合机制的特异性。此外，单次模拟轨迹只能覆盖其末端片段的部分构象空间，相比而言，基于多趟轨迹获得的结合自由能更加准确。 |
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| 作者： |
陈彦涛，李文飞，张建，王俊，王炜
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| 上传时间： |
2013-11-11 16:40:38 |
| 下载次数： |
1 |
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2
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