根据科技部《关于推荐“十一五”国家科技计划工作先进集体和个人表彰名单的通知》（国科发计〔2010〕227号）要求，经研究审核，教育部部遴选了高校“十一五”国家科技计划工作先进集体和个人，并经上网公示无异议。具体推荐名单如下：
 
1. “十一五”国家科技计划组织管理突出贡献奖（1人）
 
    谢焕忠　教育部科技司
 
2.“十一五”国家科技计划执行突出贡献奖（12人）
 
    冯长春　北京大学
    康克军　清华大学
    吴建平　清华大学
    武维华　中国农业大学
    陈建峰　北京化工大学
    郭东明　大连理工大学
    闻玉梅　复旦大学
    尤肖虎　东南大学
    徐之海  浙江大学
    管华诗　中国海洋大学
    李　亮　华中科技大学
    钟　掘　中南大学
 
3.“十一五”国家科技计划执行优秀团队（12所高校）
 
    北京大学、清华大学、天津大学、复旦大学、同济大学、上海交通大学、东南大学、浙江大学、华中农业大学、中南大学、四川大学、兰州大学
 
4. “十一五”国家科技计划执行优秀团队（25项）
 
    固体表面物理化学国家重点实验室
    固体微结构国家重点实验室
    测绘遥感信息工程国家重点实验室
    作物遗传改良国家重点实验室
    晶体材料国家重点实验室
    粉末冶金国家重点实验室
    动力工程多相流国家重点实验室
    牵引动力国家重点实验室
    国家企业信息化应用支撑软件工程技术研究中心
    国家计算机集成制造系统工程技术研究中心
    国家饲料工程技术研究中心
    国家冶金自动化工程技术研究中心（沈阳）
    国家材料环境腐蚀野外科学观测研究平台
    核磁共振找水仪研发与应用团队
    国家遗传工程小鼠资源开发与服务团队
    温室气体提高石油采收率的资源化利用及地下埋存研究团队
    光电功能晶体结构性能、分子设计、微结构设计与制备过程研究团队
    聚烯烃的多重结构及其高性能化的基础研究团队
    数字化制造基础研究团队
    量子通信与量子计算的物理实现研究团队
    水稻功能基因组研究及其相关技术平台的完善和应用研究团队
    畜禽重要细菌病基因工程疫苗研究与创制团队
    食品非热加工技术与设备研发团队
    大宗发酵产品先进发酵工艺技术研发团队
    国家应急平台体系关键技术系统与装备研究、集成和应用研发团队