科学家绘制出橡胶树基因组草图 有助提高天然橡胶产量
2016-06-28 来源：中国聚合物网
日本和马来西亚研究人员合作成功绘制出精度达93.7％的橡胶树基因组草图，这将有助于培育更加高产的橡胶树，提高天然橡胶的产量。
日本理化学研究所日前发布一份公报说，该研究所和马来西亚理科大学的研究人员对东南亚广泛栽种的橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序。他们首先利用约100个碱基短序列信息以99％以上精度进行解读的“Illumina”方法，与7000个碱基长序列信息以85％精度解读的“PacBio”方法组合，解读出高于预想基因155倍的信息量，获得了1.55Gb的橡胶树基因组草图。然后，对获得的基因组草图进行了基因组注释，预测出约84000个遗传基因，包含全部93.7％以上的遗传基因信息。研究小组利用“CAGE法”对帕拉橡胶树的叶、茎和胶乳进行RNA检测，发现了全遗传基因的基因表达量和转录起始部位。结果显示，与叶、茎相比，胶乳的天然橡胶相关基因高出100倍以上。
胶乳是脂质和蛋白质组成的称为“橡胶粒子”的乳白色小分子悬浮液。研究发现，橡胶粒子的蛋白质基因在染色体组上，形成了在转录的相同方向排列的基因簇。在获得帕拉橡胶树遗传基因信息的基础上，研究小组对各种橡胶树育种系统重新测序，得到了品种间差异的详细信息。
虽然橡胶树的原产地在巴西亚马孙热带雨林，但目前90%产出天然橡胶的橡胶树都栽种在东南亚地区。全球经济发展对天然橡胶的需求日趋增长，解读橡胶树的基因信息将有助于更科学高效地种植橡胶树，获取品质更高的天然橡胶。
要想完成全基因组测序通常需要花费大量的时间和人力，因此很多时候都是绘制基因组草图。这一研究成果已经发表在英国《自然》杂志子刊《科学报告》上。
原文链接：The rubber tree genome shows expansion of gene family associated with rubber biosynthesis
胶乳是脂质和蛋白质组成的称为“橡胶粒子”的乳白色小分子悬浮液。研究发现，橡胶粒子的蛋白质基因在染色体组上，形成了在转录的相同方向排列的基因簇。在获得帕拉橡胶树遗传基因信息的基础上，研究小组对各种橡胶树育种系统重新测序，得到了品种间差异的详细信息。
虽然橡胶树的原产地在巴西亚马孙热带雨林，但目前90%产出天然橡胶的橡胶树都栽种在东南亚地区。全球经济发展对天然橡胶的需求日趋增长，解读橡胶树的基因信息将有助于更科学高效地种植橡胶树，获取品质更高的天然橡胶。
要想完成全基因组测序通常需要花费大量的时间和人力，因此很多时候都是绘制基因组草图。这一研究成果已经发表在英国《自然》杂志子刊《科学报告》上。
原文链接：The rubber tree genome shows expansion of gene family associated with rubber biosynthesis
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（责任编辑：xu）
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