“目前只是不再进入新学校，‘985工程’和‘211工程’仍在继续”。中国农业大学教务处副处长周旭峰告诉《科学新闻》，目前“985”三期正在进行之中。这意味着已经进入工程的高校仍将继续自己的目标，并将继续获得大量的支持。

 

“1998年的时候，每个学校科研经费校均1个亿，非常低，到了2007年达到7个亿，有的学校已经达到12个亿，而校均科研经费达到12个亿的水平相当于美国AAU（美国大学联合会）所属高校的校均水平，相当于澳大利亚八校联盟的校均水平，所以这个支持力度是相当大的。”郝平这样介绍“985”工程对于高校的支持力度。

 

在21世纪教育研究院副院长、上海交通大学教授熊丙奇看来，“985”“211”工程本身就是一个“教育项目”，学校争取获得这个大项目的立项支持。而在具体的办学中，获得国家重点学科、建立博士点、发展学科基地、建设重点实验室、研究中心，都意味着可以获得更多国家专项的支持；教授们申请到各类政府基金、科研项目越多，意味着学校能进账更多办学经费。这些既可以做大学校经费蛋糕，也可解决教师待遇问题，自然没有学校能无动于衷。

 

“近年来，不断揭露的申报项目、申报成果中的造假丑闻、公关丑闻，以及申报成功之后的经费黑洞、经费浪费问题，根源就在于大家在玩一场资源争夺游戏，而没有把教育与学术真正当一回事。”熊丙奇说。

 

程莹则表示，国家对于两项工程的重点支持除了经费，另外在自主办学和方方面面的改革上（自主设置本科专业和一级学科博士点，自主招生改革等），相关高校也都得到教育部支持，走在了全国高校的前列。但暴露的一个弊端是，主管部门在决定资助对象和资助经费方面的权力很大，而大学要想获得支持必须高度重视和教育部的关系，这会导致教育部对高等学校的实际控制力进一步加大。

 

“在教育系统，学校、地方教育部门向上级管理部门‘讨钱花’，教育部门向政府计划部门、财政部门‘讨钱花’，已经是获得办学资金的基本模式。此前，教育系统的诸多工程、计划，包括‘985工程’‘211工程’、国家精品课程、100篇优秀博士论文、跨世纪人才计划，无不出于此。”熊丙奇说。在他看来，若是希望真正可以保证资金的使用，要建立国家教育拨款委员会，负责教育投入的预算和监督。也就是说，对于教育投入，不是由政府部门决定，而是由教育拨款委员会依照《教育法》《高等教育法》《民办教育促进法》等法律法规，确定教育拨款预算，然后按照预算进行拨款，对于没有按预算投入的行为，将依法问责。

 

大连理工大学的贺高红则建议，在此类工程中应该设立准入和淘汰机制，这样可以带来相应的竞争。