潘懋元认为，许多地方高校，在其创办与发展过程中，也为高等教育的体制改革、教学改革，提供了许多创新性的措施与经验。但在从数量增长到质量提高的过程中，面临许多需要解决的问题。

 

首先是定位不明，同质化的倾向严重。由于受传统观念的影响，地方高校在定位和办学思路上模仿研究型大学，同质化倾向严重。因此要分类指导，分类发展。绝大多数地方高校应定位于应用型、职业型，为地方经济发展培养适用人才。

 

其次是发展方向不明，为地方服务的意识不强，力度不够。不少地方高校朝着研究型、培养学术型人才方向发展，不能适应地方经济的需求。因此要改革现有的评估制度，建立分类评估的体系。

 

再次是行业特色的淡化与消失。原部委所属高校转制之后，与行业的关系渐渐疏远，行业特色淡化，甚至消失。行业特色高校应主动与相关行业发展紧密联系起来，为行业发展服务，走与行业发展良性互动的办学道路。

 

此外是地区经济发展不平衡，带来了地区高校发展不平衡，有些地方高校经费十分困难，难于持续发展。各级政府应切实重视对教育经费的投入；对确实困难的地区，中央财政要加强转移支付。

 

最后是优质教育资源不足，尤其是师资队伍水平偏低，结构不合理，“学术型”较多而“技术型”较少，成为提高教育质量的“瓶颈”。因此要重视加强师资队伍的建设，改进教师评聘制度。重视“双师型”人才的培养与引进，提高教师水平，形成结构合理的师资队伍。

 

潘懋元建议，在实践上，必须将科学定位和发展方向，落实到办校的各项措施——教学、科学研究、社会服务、管理工作等等。“学校的中心工作是教学，培养应用型人才的核心是应用型课程建设，要将传统的学术型课程转变为应用型课程。”

 

北京教育科学研究院院长时龙以首都高等教育发展状况为例，提出如下10个问题：用什么样的发展观来认识目前条件下高等教育的发展；如何寻找高等教育规模扩大和质量提高之间新的平衡点；用什么样的标准来衡量目前条件下高等教育的质量；高等教育工业化倾向会不会导致高等教育发展的平庸化；高校趋同化倾向和高校特色要求的矛盾如何解决；如何把握高等教育规模、速度、结构、质量、效益、特色之间的关系；推进高等教育的发展需要解决教育者和受教育者的问题；高等教育资源高度集聚的区域，如何发挥高校的社会服务功能；高等教育普及化是否仅从高等教育适龄人口入学率来衡量；目前高等教育是否存在精英不精和技能缺失并存的问题。

 

江苏省教育厅副厅长丁晓昌则以长三角区域高等教育发展状况为例分析，在推进长三角高等教育合作的过程中，需要充分发挥高校、政府、市场和联动中介机构等多方面的积极性，建立符合长三角区域高等教育特点的治理结构和推进机制。