燃料乙醇最广泛和近期的用途就是车用乙醇汽油，因此，为鼓励乙醇燃料生产，国家出台了相应的补贴优惠政策：在结算时，保证乙醇厂每吨燃料乙醇有100元左右的利润。即便如此，燃料乙醇生产企业面临的成本压力仍旧不小。
    3月1日召开的跨国公司中国论坛上，河南天冠集团宣传部刘部长介绍，天冠集团生产的燃料乙醇已独霸河南市场。而根据国家八部委的安排，其还将市场延伸到邻近的湖北和河北某些城市。但是天冠集团在河南并未享受到市场垄断所带来的超额利润，倒是一直在赔本卖燃料乙醇。据了解，天冠集团主要是靠小麦来生产乙醇，生产一吨燃料乙醇的成本大致在5000元以上，如此高的成本，使得天冠在享受了国家优惠政策后仍然有亏损，并没有所谓的100元左右的利润。
    国务院扶贫办中国地区开发产业发展中心副主任张明华说：“从目前来看，国家每年要拿出20多亿元来补贴这四个燃料乙醇生产企业（吉林燃料乙醇、黑龙江华润酒精、河南天冠集团、安徽丰原燃料酒精），但随着国家乙醇汽油推广范围的扩大和乙醇汽油消耗的增长，国家对乙醇的补贴负担会越来越重，根据相关政策，在未来的几年里，对乙醇生产的补贴会逐年递减，这对生产企业来说压力不小。”
    如何解决原料替代问题，降低燃料乙醇的高成本是四大乙醇生产企业（吉林燃料乙醇、黑龙江华润酒精、河南天冠集团、安徽丰原燃料酒精）不可回避的难题。
    2006年底，国家发改委下达紧急通知，我国生物燃料乙醇项目的原料应坚持以非粮为主，重点支持木薯、甜高粱以及纤维资源等非粮原料产业发展。然而因各地气候、环境差异大等问题，我国非粮原料资源也很有限。
    2007年，作为生物燃料乙醇向“非粮”发展的转折点，国家批准中粮与中国石化合资在广西建设20万吨/年木薯燃料乙醇装置，并配套相应的木薯原料种植基地。然而这一举措对当地以木薯为原料的淀粉加工业造成了一定的冲击。
    走向国际市场是解决乙醇生产原料困境的途径之一
    据了解，壳牌、BP(英国石油公司)国际巨头已经加入到燃料乙醇产业中，让燃料乙醇在大宗商品中的地位更加重要。作为全球最大的乙醇出口国，巴西一直鼓励中国进口该国生产的燃料乙醇。巴西甘蔗行业协会官员曾表示，中国的决定对巴西未来乙醇行业发展非常有利，如果中国决定与巴西公司签订长期合同，那么这将最终提振巴西乙醇生产投资。
    与此同时，中国自身的燃料乙醇产业却和市场发展目标有所脱节。
    2009年我国燃料乙醇总量约为170万吨，仍然有80%的原料来自玉米，与美国玉米燃料乙醇一样，国内燃料乙醇企业依然通过政府补贴保持微利。尽管目前中国只有两广等周边地区适合木薯种植，内蒙古、河北、山东等北方地区适宜种植甜高粱，但资源量都有限。
    以安徽丰原集团为例，安徽丰原集团积极走出去，到东南亚国家购买当地土地种植木薯来供给企业生产所需原料。农业部规划设计研究院高级工程师肖明松说：“走出去是解决乙醇生产原料困境的途径之一，但需要承担比国内更大的风险，除应承担来自自然的风险以外，还涉及到当地政府政策、劳动力成本、运输成本等一系列问题。”
    另外，由于燃料乙醇价格随国际油价波动而波动，因此有专家测算，只有当原油价格上升到每桶80到90美元时，生物燃料乙醇才能迎来春天。“我国成品油价格是国家政府行政控制的，因此生物燃料乙醇一方面受到来自国国际市场的影响，另一方面又受原料价格波动的影响，两面受挫，处境比较艰难。”中粮科学研究院武国庆博士说。
    降低成本还需假以时日
    据了解，作为全球最大的乙醇出口国，巴西2009年燃料乙醇产量为1900万吨，正在觊觎中国的车用燃料市场。肖明松向本报记者透露，巴西多次派代表团来华要求对我国出口乙醇酒精，并没有获得政府部门认同，主要原因是进口乙醇会对国内刚刚形成的生产、管理、市场、产业政策以及财税补贴办法等造成巨大冲击。
    然而，就中国自身的燃料乙醇产业来讲，却和市场发展目标有所脱节。截至目前，国内5个燃料乙醇项目除河南天冠外，中粮已经以控股和参股形式掌握其中四个，成为该行业领跑者。
    国内外燃料乙醇的现状
    根据《生物燃料乙醇以及车用乙醇汽油“十一五”发展专项规划》，到2010年，我国将以薯类、甜高粱等非粮原料为主生产522万吨燃料乙醇，届时乙醇汽油使用量将占全国汽油用量的75%。
    到2020年，我国燃料乙醇年产量可达1000万吨。其实，可再生能源会议作出的停止在建的乙醇燃料项目，这只是阶段性的选择，之前，国家出发改委也多次通知，要求新上燃料乙醇项目“刹车”，然而，效果不尽人意。如何破解隐藏在问题背后的“发展”与“资源”之间矛盾，却需要国家有关部门用更长的时间来求解。按理说，食品和能源经济并不相关，但是目前正在趋于紧密关联。当石油价格上涨时，食品价格也会上涨。据大连商品交易所公布信息称，国内玉米价格在过去9个月里上涨了近30%，其原因是人们把玉米用于生产燃料乙醇所致。
    小常识：
    燃料乙醇主要原料：燃料乙醇的主要原料有雅津甜高粱、玉米、木薯、海藻、雅津糖芋、苦配巴树等。
    燃料乙醇的使用：乙醇汽油的保质期只有一个月。过了保质期的乙醇汽油容易出现的分层现象，在油罐油箱中容易变浑浊，打不着火。
    乙醇汽油对环境要求非常高，非常怕水，保质期短，因此销售乙醇汽油要比普通汽油在调配、储存、运输、销售各环节要严格得多。一般小油站不出售乙醇汽油。