属于水性涂料制备工艺技术领域，具体涉及有机硅改性水性聚氨酯复合材料及其应用。本发明的有机硅改性水性聚氨酯复合材料是首先制备含氨基的梯形聚倍半硅氧烷;然后将其与端基为-NCO的亲水性聚氨酯预聚体反应，生成有机硅改性水性聚氨酯预聚体，最后加入碱性中和剂、蒸馏水，搅拌分散。本发明的特点是含氨基的梯形聚倍半硅氧烷的氨基可以与端基为-NCO的亲水性聚氨酯预聚体的-NCO反应，而使预聚体扩链，且有交联反应发生，制得的复合材料的耐水性大大提高。同时，由于梯形聚倍半硅氧烷的引入，聚氨酯的硬度及耐热性也得到显著的提高。本发明的复合材料可作为木材、纸张等的表面涂膜材料使用，或作为织物与皮革的涂饰剂使用等。