交通部海事局在上海发布世博会水上交通管控方案，世博会期间上海将成立水上交通管控和应急指挥中心，并严格实施水域划分、船舶准入、总量控制、作业限制、客轮禁污、危险品货物押运护航等措施。
    据悉，世博会水上交通管控方案共包含四大内容：成立上海世博会水上交通管控和应急指挥中心，管控船舶动态，协调水上通航秩序和秩序管理，加强危险品和防止船舶污染水域管理，指挥应急行动并提供必要的技术支持；实施水上交通管控，根据不同时期的工作需要，对水上实施三级管控措施，在相关水域部署巡逻船艇、拖轮、打捞船和清污船等；加强应急保障，针对可能出现的险情，制订涉及船舶防台、碰撞、失控、污染及人员救助等险情的应急预案；加快推进信息平台建设和应用，由世博水上交通指挥系统掌握和处理全国驶往上海港船舶的信息，由世博会水上交通管控信息咨询中心负责人机互动的电话咨询平台。
    海事部门和公安部门还特别明确，世博期间所有危险品船舶须由上海市公安局水上公安局安排保安登轮押运，并在海事巡逻艇护航下通过黄浦江核心管制区，停靠上海港的危险品船舶将接受总量控制和作业时间限制。海事部门还明令行驶于世博园区的客轮封闭污水管道、强制配备垃圾容器，废水等生活垃圾交由岸上单位处置。
    早先，上海市交通港口局公布了世博期间客货运码头安全管控方案。其中，客运、货运危品、涉外码头等将通过图像方式重点监控。而上海各港口将基本禁止危险、化学品进港。
    按照方案，到3月底，本市辖区客货运码头安全管控能力将实现全面提升。本市各类水路客运码头（含市轮渡、水上旅游）、海港危品码头、涉外码头等都将安装彩色监控设备，可至少保留30天的监控记录。
    2010年4月30日起至10月31日，除洋山港区外，上海港原则上禁止爆炸品、有机过氧化物、剧毒品、放射性物品及过氧化氢、丙酮、硫酸、硝酸、盐酸等危险货物的港口作业，确需在外高桥港区出口烟花爆竹时，实施“一船一报”。