据了解，由工业和信息化部发布的《新能源汽车生产企业及产品准入管理规则》于2009年7月1日起正式施行。甲醇汽车未被列入。准入管理规则第一章第三条规定，本规则所称新能源汽车，包括混合动力汽车、纯电动汽车（BEV，包括太阳能汽车）、燃料电池电动汽车（FCEV）、氢发动机汽车和其他新能源（如高效储能器、二甲醚）汽车等各类别产品。而在山西、陕西等省份已推广多年，国内多家汽车厂商投入研制多年并取得一定成果的甲醇汽车却榜上无名。
    有关专家对于甲醇汽车被排除在外进行了分析。
    清华大学汽车工程研究院常务副院长宋健分析，尽管甲醇汽车在节能、环保等方面明显优于传统汽车，可作为替代型能源进行小规模推广使用。但甲醇属于中等毒性物质，小规模掺入汽、柴油中搭配使用不至于对环境及人类身体健康产生多大危害，但真要大规模化推广应用，其毒性随之扩大而带来的危害谁也无法预料。因此，甲醇汽车对于新能源汽车产业的发展意义并不大，《新能源汽车生产企业及产品准入管理规划》未将其收录实属正常。
    上海内燃机研究所新能源发动机研究室副主任齐洪元认为，屡屡发生的假酒案，不法商贩把价格便宜的甲醇当做工业酒精制成白酒，导致消费者死亡，这些案例给公众造成甲醇剧毒的“集体意识”。大家谈甲醇色变，这一意识不仅存在于民间，在一些政策制定者中同样存在。
    关于甲醛排放问题，山西省醇汽办副主任降连葆告诉记者，M100甲醇车排放的甲醛低于柴油车，但高于汽油车。甲醛在常规汽油车排放量为3～4毫克/千米，甲醇车排放量为10毫克/千米。这也是甲醇汽车没能入围新能源汽车准入管理规则的另一原因。据悉，目前的汽车尾气排放国家标准中没有甲醛排放量的指标。美国加州有个甲醛标准，允许每英里排放16毫克，换算过来也等于每千米10毫克。