本发明涉及一种多金属氧簇杂化聚合物微球的制备方法，包括用于包覆多金属氧簇的聚合阳离子表面活性剂的合成、聚合阳离子表面活性剂包覆多金属氧簇制得聚合复合物、聚合复合物与有机单体通过细乳液聚合制得杂化聚合物微球三个步骤。在制备过程中，聚合阳离子表面活性剂起到了关键性的作用，一方面通过静电包覆，在保持多金属氧簇自身功能特性不变的情况下，对其表面改性并转移有机单体液滴；另一方面通过聚合基团与聚合物链段共价相连，实现了多金属氧簇与聚合物基材在分子尺度的杂化，从而有效提高了杂化聚合物微球各组分之间的相容性，使最终的杂化微球具有良好的稳定性。本发明所得材料可应用于涂料制备、生物标记和催化等领域